Modules die voorzien in zoekpagina-plugins zorgen er gewoonlijk voor dat na inhoudsgerelateerde acties op de site (inhoud of reacties toevoegen, bewerken of verwijderen) automatisch de beïnvloedde inhoudsitems gemarkeerd worden voor indexatie of herindexatie bij de volgende cron-run. Als inhoud gemarkeerd is voor herindexatie, blijft de huidige content in de index, en wordt tijdens de cron-run vervangen door de nieuwe inhoud. Er zijn echter een aantal acties die te maken hebben met de structuur van de site die deze markering niet uitvoeren. Bijvoorbeeld het verwijderen of bewerken van taxonimietermen, het in- of uitschakelen van modules die tekst aan inhoud toevoegen (zoals Taxonomy, Comment, en modules die velden toevoegen), en het bewerken van de velden of weergaveinstellingen van de inhoudstypes. Als een van deze acties uitgevoerd wordt, en de zoekindex moet bijgewerkt worden om de wijzigingen te weerspiegelen, kan alle inhoud gemarkeerd worden voor herindexatie met de knop 'Site opnieuw indexeren' op de pagina <a href=":search-settings">Zoekpagina's</a>. Als er veel inhoud aanwezig is op de site kan het een aantal cron-runs duren voordat alle inhoud opnieuw geïndexeerd is.